MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Methanohalophilus mahii DSM 5219 chromosome

Total Repeats: 5522

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_014002	AAAT	2	8	1085144	1085151	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
3002	NC_014002	ATT	2	6	1085200	1085205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3003	NC_014002	ATG	2	6	1085404	1085409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3004	NC_014002	TAG	2	6	1085428	1085433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3005	NC_014002	TGA	2	6	1085435	1085440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_014002	A	6	6	1086425	1086430	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3007	NC_014002	AT	5	10	1086473	1086482	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3008	NC_014002	T	7	7	1086489	1086495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_014002	AT	4	8	1086513	1086520	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_014002	TAAC	2	8	1086535	1086542	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3011	NC_014002	ATA	2	6	1086561	1086566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_014002	CTTT	2	8	1087524	1087531	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
3013	NC_014002	T	7	7	1087529	1087535	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3014	NC_014002	GGA	2	6	1087574	1087579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3015	NC_014002	CTTCT	2	10	1087581	1087590	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
3016	NC_014002	CTG	2	6	1087619	1087624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3017	NC_014002	AACAT	2	10	1087781	1087790	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
3018	NC_014002	ATA	2	6	1087802	1087807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3019	NC_014002	TAA	2	6	1087882	1087887	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3020	NC_014002	CATT	2	8	1087891	1087898	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3021	NC_014002	GA	3	6	1087935	1087940	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
3022	NC_014002	ATT	2	6	1087960	1087965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3023	NC_014002	ATA	2	6	1088003	1088008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3024	NC_014002	CAT	2	6	1088047	1088052	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3025	NC_014002	TGC	2	6	1088078	1088083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3026	NC_014002	TTGCAT	2	12	1088093	1088104	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
3027	NC_014002	GCAG	2	8	1088170	1088177	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3028	NC_014002	GCA	2	6	1088209	1088214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_014002	ACT	2	6	1088257	1088262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3030	NC_014002	TAT	2	6	1088330	1088335	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_014002	CAT	2	6	1088393	1088398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_014002	TAC	2	6	1088495	1088500	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_014002	TCT	2	6	1088521	1088526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3034	NC_014002	TATT	2	8	1088581	1088588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3035	NC_014002	TA	3	6	1088604	1088609	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3036	NC_014002	GAG	2	6	1088612	1088617	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_014002	TAT	2	6	1088708	1088713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_014002	TA	3	6	1088778	1088783	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_014002	ATTAAT	2	12	1088800	1088811	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3040	NC_014002	TAA	2	6	1088821	1088826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3041	NC_014002	TCA	2	6	1088882	1088887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_014002	TA	3	6	1088909	1088914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3043	NC_014002	TAA	3	9	1088940	1088948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3044	NC_014002	CAT	2	6	1088994	1088999	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3045	NC_014002	TAA	2	6	1089008	1089013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_014002	TACA	2	8	1089017	1089024	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3047	NC_014002	AATGA	2	10	1089042	1089051	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
3048	NC_014002	ATT	2	6	1089062	1089067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_014002	TGAA	2	8	1089069	1089076	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_014002	ATA	2	6	1089078	1089083	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_014002	TGA	2	6	1089091	1089096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3054	NC_014002	CAA	2	6	1089608	1089613	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3056	NC_014002	TAT	2	6	1090258	1090263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3057	NC_014002	AAGATA	2	12	1090359	1090370	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
3058	NC_014002	ATTT	2	8	1090373	1090380	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3059	NC_014002	AT	3	6	1090405	1090410	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3060	NC_014002	GCA	2	6	1090448	1090453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3061	NC_014002	TGGT	2	8	1090474	1090481	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3062	NC_014002	ATTGG	2	10	1090495	1090504	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
3063	NC_014002	TGT	2	6	1090529	1090534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3064	NC_014002	GCA	2	6	1090635	1090640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3065	NC_014002	TGCT	2	8	1090655	1090662	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
3066	NC_014002	A	6	6	1091149	1091154	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3067	NC_014002	TAC	2	6	1091196	1091201	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3068	NC_014002	AAGA	2	8	1091262	1091269	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
3069	NC_014002	CTTA	2	8	1091287	1091294	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3070	NC_014002	AT	3	6	1091315	1091320	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_014002	AATA	2	8	1091347	1091354	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3076	NC_014002	ATA	2	6	1093488	1093493	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3080	NC_014002	CAGC	2	8	1093669	1093676	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3081	NC_014002	TAT	2	6	1093690	1093695	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3082	NC_014002	AGG	2	6	1093724	1093729	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3083	NC_014002	AGGC	2	8	1093831	1093838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3084	NC_014002	GAT	2	6	1093887	1093892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_014002	T	6	6	1093923	1093928	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3088	NC_014002	AAT	13	39	1094067	1094105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3089	NC_014002	GCT	2	6	1094137	1094142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_014002	ATTC	2	8	1094149	1094156	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3091	NC_014002	T	6	6	1094196	1094201	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3092	NC_014002	GCA	2	6	1094224	1094229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_014002	A	6	6	1094651	1094656	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3094	NC_014002	GAA	2	6	1094706	1094711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3095	NC_014002	TA	3	6	1094790	1094795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_014002	A	6	6	1094806	1094811	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3097	NC_014002	TCG	2	6	1094830	1094835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3099	NC_014002	ATT	2	6	1094954	1094959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3100	NC_014002	CATG	2	8	1094985	1094992	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
3101	NC_014002	TAT	2	6	1095051	1095056	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3102	NC_014002	GCCG	2	8	1095082	1095089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3103	NC_014002	AGGGG	2	10	1095154	1095163	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
3104	NC_014002	AAG	2	6	1095374	1095379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3105	NC_014002	AACCG	2	10	1095423	1095432	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
3106	NC_014002	TGA	2	6	1095443	1095448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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3108	NC_014002	CCG	2	6	1095541	1095546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3109	NC_014002	ATC	2	6	1095582	1095587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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3111	NC_014002	AT	3	6	1095760	1095765	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3112	NC_014002	ACA	2	6	1095802	1095807	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3113	NC_014002	TCA	2	6	1095813	1095818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_014002	AGCCGG	2	12	1095823	1095834	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
3115	NC_014002	GAACCA	2	12	1095852	1095863	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_014002	A	6	6	1095897	1095902	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3117	NC_014002	ATTT	2	8	1096627	1096634	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3120	NC_014002	GAAAA	2	10	1096797	1096806	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_014002	AAT	2	6	1096832	1096837	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3123	NC_014002	ATA	2	6	1097202	1097207	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3124	NC_014002	TCAA	2	8	1097265	1097272	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
3125	NC_014002	ATA	3	9	1097380	1097388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3126	NC_014002	AT	4	8	1097400	1097407	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3127	NC_014002	TTG	2	6	1097408	1097413	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3128	NC_014002	AGA	2	6	1097422	1097427	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3129	NC_014002	TATT	2	8	1097450	1097457	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
3130	NC_014002	ATT	2	6	1097626	1097631	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3131	NC_014002	ATA	2	6	1097634	1097639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3132	NC_014002	TAAT	2	8	1097703	1097710	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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3394	NC_014002	ATTC	2	8	1157114	1157121	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
3395	NC_014002	TA	3	6	1157139	1157144	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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